Prime Editing点突变细胞构建实验流程及应用常见问答
常见问答
Q:KI修复模板选择和设计?
A:在PE里面是不存在KI模版的,只需要将我们想改变的碱基序列设计在peg的3’端就可以了。
Q:抗性浓度摸索和细胞倍增时间怎么优化?
A:因为细胞扩增时间越长,对抗生素就越敏感。我们一般会设定筛选的时间大约在细胞扩增两次的时间。
Q:PE点突变细胞构建实验一般用多少载体?
A:一般用3-4个载体,一个载体表达PE蛋白,一个载体表达pegRNA,MLHDN和nicksgRNA这两个载体按实验需求使用。
Q:载体的比例是怎样的?
A:一般是PE载体用量大一些,其次是pegRNA,然后是MLHDN和nicksgRNA,因为PE载体比较大,也是实验的主要元件,所以用量会多一些。具体比例根据细胞而异。
Q:一般会设计几个PE?
A:根据位点情况一般设计2-3组,然后根据RBS长度,PBS长度,RTT长度去选择最优的PE。
Q:多克隆测序分析工具有哪些?
A:①Synthego ICE Analysis Tool ②TIDE
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