【直播回顾】CRISPR激活文库实验及应用
1月26日15:00,艾迪基因首席科学家张旭博士开展了主题为[CRISPR激活文库实验及应用]线上课程,详细介绍了CRISPR文库筛选原理以及CRISPR激活文库的应用。在最后答疑阶段,老师们踊跃提问,并且得到了满意的解答,接下来,让我们来回顾一下本次直播的精彩问答~
精彩问答
Q:测序文库的覆盖率低怎么办?
A:看您是质粒文库还是筛选完的文库,如果是质粒文库,可能是质粒文库的质量很差导致的覆盖率低;如果是阳性筛选完的文库覆盖率低是正常的,因为阳性筛选完已经杀死了很多细胞,sgrna少是正常的;如果是阴性筛选完的文库覆盖率低,可能是因为实验过程中的误差比较大。
Q:经过编辑的细胞都是有抗生素抗性是吗?
A:我们构建稳转株的时候,细胞都是有抗性的,但也可以用流式的方式,在cas后面加gfp,通过流式分选的方式解决,
Q:dcas9稳定株需要挑选单克隆吗?
A:我们一般用细胞池,激活文库如果是用转座子的方式一般使用细胞池。
Q:文库筛选需要考虑脱靶的问题吗?
A:因为现在文库已经发展得比较成熟,所以现在脱靶不是一个大问题。
Q:pb转座子是敲除还是敲入?
A:Pb转座子主要是为了把CAS、VP64和MCP这些蛋白随机整合到基因组上面去,所以算是敲入。
以上是这次直播课部分问答,更多精彩内容可在B站:广州艾迪基因,查看本次直播回放>>
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