【一周时讯】CRISPR-Cas9筛选技术提供更灵敏和更特异识别胎儿血红蛋白诱导剂的方法
CRISPR/Cas系统作为现代生物科学领域革命性的技术工具，其影响力涉及医学、农业、生态保护等多个领域。每周，有关CRISPR的最新研究进展和应用案例都在不断涌现，为我们的生活带来深远的影响。以下，是过去一周关于CRISPR技术的研究资讯及行业新闻的简单介绍：
一、研究资讯：
（一）CRISPR筛选
文章题目：A cellular reporter system to evaluate endogenous fetal hemoglobin induction and screen for therapeutic compounds
期刊：HemaSphere（IF：12.1）
原文链接：https://doi.org/10.1002/hem3.139
近期，荷兰研究人员发表了他们的最新研究成果---一种用于评估内源性胎儿血红蛋白诱导并筛选治疗化合物的CRISPR-Cas9 介导的新型报告细胞系。这种新型检测方法旨在通过利用报告细胞系来识别胎儿血红蛋白 （HbF） 的诱导剂，该细胞系是第一个成功标记内源性胎儿珠蛋白基因 HBG1 或 HBG2 的细胞系。新的测定方法基于HUDEP2细胞，它与成人红系祖细胞非常相似，不像原代红系细胞那样在应激下上调HbF。该研究使用 CRISPR-Cas9 介导的敲入在 HBG1 基因上整合生物发光标签，并成功表明所得的报告细胞系反映了 HUDEP2 特征，从而能够以高灵敏度和特异性报告胎儿血红蛋白诱导。这个新工具提供了一种更特异、更敏感的方法来识别潜在的HbF治疗诱导剂，对比以前的系统有了显著的进步。
文章题目：Genome-wide CRISPR-Cas9 knockout screens identify DNMT1 as a druggable dependency in sonic hedgehog medulloblastoma
期刊：Acta Neuropathologica Communications（IF：6.2）
原文链接：https://doi.org/10.1186/s40478-024-01831-x
平滑 （SMO） 抑制剂在治疗髓母细胞瘤方面显示出前景，但是它的耐药性仍然是一个持续的挑战。为了解决这个问题，德国研究人员使用全基因CRISPR-Cas9敲除筛选来研究遗传依赖性和药物相关的遗传相互作用物，以此寻找髓母细胞瘤声Sonic hedgehog亚组（SHH-MB）的替代治疗靶点。研究结果确定DNA甲基转移酶1（DNMT1）为关键的表观遗传靶点。在SHH-MB模型中，单独或与SMO抑制剂一起抑制DNMT1可显着减少肿瘤生长并延长生存期。这项研究为CRISPR-Cas9敲除筛选在药物开发中的广泛应用提供了证据。
（二）CRISPR 检测
文章题目：SATCAS: A CRISPR/Cas13a-based simultaneous amplification and testing platform for one-pot RNA detection and SNPs distinguish in clinical diagnosis
期刊：Biosensors and Bioelectronics（IF：10.7）
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.bios.2024.116636
临床诊断对病原体感染性疾病的RNA检测技术要求越来越高，需要更敏感和快速的方法。CRISPR/Cas13a系统因其转录后切割活性，在分子诊断中显示出巨大潜力。然而，目前大多数基于Cas13a的检测方法需要一个转录扩增步骤，多步骤开放式操作容易导致污染。对此，北京大学和复旦大学的研究员提出了一种超灵敏（单拷贝范围，约aM级别）和快速（40分钟内）的等温一锅式RNA检测平台---SATCAS。该检测平台能够有效区分活性细菌（0%-100%），在识别单核苷酸多态性（SNPs）方面表现出色，尤其是检测0.5%的药物抗性突变。通过检测来自68名HBV、23名EBV和48名SARS-CoV-2患者的生物样本中的感染，它实现了100%的灵敏度、92.86%的特异性和97.06%的准确性。该平台适用于可培养病原体的检测和病毒性感染的临床诊断
文章题目：Harnessing the power of clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) based microfluidics for next-generation molecular diagnostics
期刊： Molecular Biology Reports
原文链接：https://doi.org/10.1007/s11033-024-09840-8
虽然CRISPR具有很高的精度，但应用仍然受到高成本、技术要求和量化困难的限制。微流控技术具有微型化和自动化过程的能力，它通过使检测更加灵敏、便携和可访问来应对这些挑战。近期，印度研究人员总结集成CRISPR系统与微流控平台的检测技术，并发表综述成果。该综述讨论了各种CRISPR-Cas系统以及它们在检测DNA和RNA生物标志物中的应用等，为推进基于CRISPR的分子诊断的应用提供参考。
（三）其他CRISPR技术
文章题目：Generation and characterization of a novel mouse model of Becker Muscular Dystrophy with a deletion of exons 52 to 55
期刊：Disease Models & Mechanisms (IF：4.3)
原文链接：https://doi.org/10.1242/dmm.050595
多伦多的一组研究人员描述了一种CRISPR-Cas9生成的新型小鼠模型，用于贝克尔肌营养不良症（BMD），这是一种迫切需要新疗法的神经肌肉疾病。这种新型小鼠模型具有外显子 52 至 55 的典型 BMD 样框内缺失，这是以前在动物模型中未出现的 BMD 突变热点。该研究比较了不同 BMD 模型，以便深入了解不同抗肌萎缩蛋白亚型的功能，并且满足对新 BMD 治疗方案日益增长的需求。
文章题目：Engineered exosomes with a photoinducible protein delivery system enable CRISPR-Cas–based epigenome editing in Alzheimer’s disease
期刊：Science Translational Medicine（IF：15.8）
原文链接：https://doi.org/10.1126/scitranslmed.adi4830
来自韩国的一组研究人员开发了一种名为MAPLEX的新型基于外泌体的递送系统的工程设计，其中货物蛋白可以通过与光裂解蛋白mMaple3融合到外泌体中，然后将其融合到外泌体标记蛋白上。该递送系统旨在克服由于基于蛋白质的疗法无法穿过细胞膜而造成的限制，从而限制了许多疾病的成功治疗。该系统成功地用于在两种阿尔茨海默病模型的大脑中实现靶向表观基因组编辑。该研究提供的证据表明，MAPLEX可能是一种有效的细胞内蛋白质递送系统，有望治疗多种疾病，这些疾病可以通过基于蛋白质的疗法得到缓解。
二、行业新闻
1、近期，Fierce Biotech 公布了他们的 2024 年 Fierce 15强名单，其中重点介绍了 15 家最有前途和最具创新性的生物技术公司。该名单包括几家基因编辑公司，包括Ascidian Therapeutics、Excision BioTherapeutics和iECURE。
新闻链接：https://www.fiercebiotech.com/special-reports/introducing-fierce-biotechs-2024-fierce-15
2、Sangamo Therapeutics与Genentech达成了一项关于开发用于神经退行性疾病的基因组药物的许可协议，重点是针对与阿尔茨海默氏症相关的tau基因的Sangamo锌指抑制物，以及第二个未公开的靶标。该协议包括Sangamo的STAC-BBB的独家许可，其中，STAC-BBB是一种具有强脑穿透能力的神经性AAV衣壳。Sangamo将获得5000万美元的预付款，潜在收益高达19亿美元，同时继续探索其基因组技术的进一步合作伙伴关系。
3、Beam Therapeutics公布了产品线更新和2024年第二季度财务业绩。该公司报告称，其使用碱基编辑技术的临床项目取得了重大进展，包括在镰状细胞病的BEACON试验中成功招募和给药患者，并启动了针对遗传疾病的试验，如α-1抗胰蛋白酶缺乏症和Ia型糖原贮积病。
4、2七十生物公布了其2024年第二季度的财务业绩和最近的运营进展，报告中包括ABECMA®的重点进展计划。ABECMA®是一种CAR-T细胞疗法，用于治疗某些类型的血液系统恶性肿瘤，特别是复发或难治性多发性骨髓瘤。
5、CRISPR Therapeutics近期公布了其2024年第二季度的财务业绩和业务更新报告。报告中包括第一个获得批准的基于CRISPR的基因疗法CASGEVY™的进展更新，以及该公司目前正在进行的其他几项临床试验。
艾迪基因专注于CRISPR技术，提供一系列高质量的基因编辑服务和体外诊断产品：CRISPR文库筛选、细胞基因编辑、单克隆筛选、CRISPR检测。致力于为CRISPR相关、基因功能研究相关、体外诊断以及治疗相关的科学研究提供最高效的技术服务。
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