RNA恒温快速扩增试剂盒(液体荧光型)使用说明书
【产品名称】
通用名称:RNA恒温快速扩增试剂盒(液体荧光型)
【包装规格】
货号:WLRE5003
规格:100T
【原理概述】
本试剂盒基于一种常温恒温核酸快速扩增技术:在常温恒温下,特殊修饰的反转录酶利用特异性引物DNA和模板RNA合成cDNA链,反应体系中的重组酶、单链DNA结合蛋白和DNA聚合酶以新合成的cDNA链为模板进行快速核酸扩增反应。本试剂盒在42 ºC下,依赖核酸外切酶的作用,加入根据模版设计的特异的分子探针,使用荧光监测设备能实现对目标片段扩增过程的实时监控。适用于实验室级别的RNA扩增以及其他检测用途的RNA扩增使用。
【引物设计】
建议使用长度在30-35 bp的引物,引物过短会影响扩增速度和检测灵敏度;引物设计避免形成二级结构而影响扩增;扩增子长度建议在150-300 bp,通常不超过500 bp。
【荧光探针设计】
探针序列不与特异性引物识别位点重叠,长度为46-52 nt,序列避免回文序列、内部二级结构和连续的重复碱基。探针共有四个修饰位点:距离5’端的≥ 35 nt的中部位置标记一个dSpacer(四氢呋喃,THF),作为核酸外切酶的识别位点;THF位点的上游标记一个荧光基团,下游标记一个粹灭基团,两个基团的间距为2-4 nt;THF距离3’末端≥15 nt,并且3’末端标记一个修饰基团,例如胺基、磷酸基团或C3-Spacer。
【试剂盒组成】
组成 |
含量 |
C buffer |
1 mL×2管 |
L buffer |
500 μL×1管 |
PR-core |
1.2 mL×1管 |
E-core |
60 μL×1管 |
B buffer |
300 μL×1管 |
使用说明书 |
1份 |
【试剂盒储存】
1.运输温度:≤ 20 ºC的恒温环境;
2.储存条件:储存温度 ≤ -20 °C的恒温环境,避光保存,避免重压、反复冻融;
3.产品有效期:6个月;
4.生产日期见外包装。
【操作步骤】
提前将试剂盒所需组分取出,冰上或低温下融化(C buffer可室温融化),震荡混匀。
(1) 向无菌0.2mL PCR管中加入20 μL C buffer、5 μL L buffer;
(2) 加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探针,
(3) 加入1.5μL dNTPs(10 mM);
(4) 加入12 μL PR-core和0.6 μL E-core(步骤1~4可以混合后再分装至反应管中);
(5) 向反应管中加入3.8 μL核酸模板;
(6) 最后向反应管中加入2.5 μL B buffer并充分混合(请务必上下颠倒甩动反应管8-10次进行混匀;对于多个反应,建议提前将B buffer加至反应管的盖子内侧,盖上盖后上下颠倒后混匀);
(7) 混匀后,将反应液甩(或快速离心)至管子底部,然后立即将反应管放入荧光检测设备中。荧光检测程序设置为:恒温42 ºC;每30 s采集一次荧光信号;反应时间20 mins。
注:如使用ABI系列PCR仪,请务必于passive reference和quencher处均选择“none”。
体系配制
组分 |
体积(μL) |
C buffer |
20 |
L buffer |
5 |
PR-core |
12 |
E-core |
0.6 |
dNTPs(10 mM) |
1.5 |
下游引物(10 μM) |
2 |
下游引物(10 μM) |
2 |
探针(10 μM) |
0.6 |
核酸模板 |
3.8 |
B buffer |
2.5 |
总体积 |
50 |
【注意事项】
1. 由为保证液体试剂组分活性,请保证储存温度 ≤ -20 ºC;试剂使用时请保持低温,避免高温放置过长时间;
2. 在进行反应时请注意避免微量核酸染,并设置空白对照实验组。